最近发表在《海洋科学前沿》(Frontiers in Marine Science)上的一篇研究报告表明,环境DNA(eDNA)可以为海洋调查提供有价值的细节信息。大白鲨和鲑鱼等重要的海洋生物通常能从拖网逃脱,使人们无法通过拖网调查获知该海域是否存在这些生物,然而eDNA技术却能让人们了解它们的行踪。研究还发现,当海洋生物的栖息地随着海洋的变化而改变时,持续收集eDNA信息也可以帮助人们检测海洋环境的变化。
斯坦福大学海洋解决方案中心(Center for Ocean Solutions at Stanford University)的年轻研究员科林·柯塞科(Collin J. Closek)说,“eDNA信息补充了一些我们可能无法从其他途径获得的细节,并为我们提供了更完整的海洋环境和海洋生物信息。”柯塞科是该研究报告的第一作者,其他合作作者分别来自于斯坦福大学(Stanford University)、加利福尼亚大学圣克鲁兹分校(University of California Santa Cruz)和美国国家海洋和大气管理局(NOAA)西南渔业科学中心。
功能强大的遗传工具
海洋生物不断地将一些遗传物质散布到周围海水中。通过eDNA技术,研究者从水样中提取DNA,并识别其来源。新的实验室测序方法可以帮助研究者一次检测许多样本。作为一种遗传工具,eDNA技术帮助研究者检测曾经经过该水域的生物种类。
柯塞科说,收集水样并将其存档,可以为特定水域在特定时期的DNA痕迹留下永存记录,也使科学家可以在数年后还能借助这些记录开展相关研究。
西南渔业科学中心的生态学家埃利奥特·哈森(Elliott Hazen)是本研究报告的共同作者,他表示:“eDNA技术对我们识别物种分布很有帮助,不仅可以让我们进行快速采样,而且一旦理解eDNA所传达的信息,我们就可以快速获知海洋生物的许多信息。”
但是,eDNA技术并不能提供所有的信息。例如,当前的eDNA测序结果还不能让研究人员计算出每个物种的数量或丰度,也不能确定物种的年龄或大小。这意味着eDNA技术在短期内不会取代拖网调查和声学测量等传统的监测手段。
柯塞科和他的同事们于2016至2017年间在美国国家海洋和大气管理局的鲁本·拉斯克号船上(NOAA Ship Reuben Lasker)开展实地调查。他们参加了美国国家海洋和大气管理局渔业部门的石鱼(rockfish)增殖放流和生态系统评估调查,该调查自1983年以来对加利福尼亚海域目前的生物种群进行评估。eDNA研究团队收集了131个水样本,每个样本为1升水,样本采集地点大致与船只部署的拖网地点相同。他们采集了幼年石鱼和其他生物种群的样本,同时统计了白天在船上看到的海洋哺乳动物和海鸟的数量,然后对比了这两种来源的数据。这是在浩瀚的西海岸海域首次运用eDNA技术开展的实地调查。
eDNA技术鉴定出更多物种
西南渔业科学中心的渔业生物学家约翰·菲尔德(John Field)说,拖网调查在过去两年中在该海域发现了28种鱼类,其中11种仅在拖网调查中发现,而eDNA技术未发现;eDNA发现了65种不同的海洋脊椎动物,其中包括鱼类和海洋哺乳动物;eDNA技术和拖网调查共同确定了80种不同的鱼类和海洋哺乳动物,其中包括须鲸、鼠海豚(porpoises)、海豚、海豹和海狮。
他说:“eDNA技术检测到了鱼类和海洋哺乳动物,这个结果印证了我们在开展调查前的预测,也使我们对eDNA技术更有信心,我们相信它能帮助我们了解更多的物种信息。这可能听起来没什么了不起,但确实验证了eDNA技术检测海洋生物信息的有效性。”
如果把2016年和2017年进行比较,我们会发现,生物物种及其分布存在年际差异。2016年“暖水团”(the Blob)海洋热浪的残存热量正在消散,一些本来在西海岸不多见的温水物种却在该海域广泛分布。2017年,情况又恢复了正常。这些不多见的生物物种从该海域大量消失。eDNA技术发现,该海域不同地方的海洋脊椎动物种类存在巨大差别。这些结果表明,eDNA技术可以帮助研究人员追踪环境的变化。
亚历山大·勃姆(Alexandria Boehm)是斯坦福大学土木与环境工程系的资深教授,他也是本研究报告的合作作者之一,他说:“我们没有足够的人力和财力对任何海域进行全方位的调查,eDNA技术可以帮助我们拓展我们的研究范围。通过研究我们发现,eDNA技术、拖网调查和声学测量等方法获得的海洋环境和生物信息有相同之处,也验证eDNA技术是值得信赖的,它能够让人类更了解海洋环境和海洋生物。”
编译:夏凡
审校:邹磊磊
来源网站:Science Daily 网