在浩瀚的海洋中,人们会认为海洋生物可以游得很远、很广,因此,一个物种的种群可以自由混合。但对于玉筋鱼(the sand lance)而言,这种鱼是作为饵料的重要来源,情况似乎并非如此。
康涅狄格大学(University of Connecticut)海洋科学副教授汉内斯·鲍曼( Hannes Baumann)表示,玉筋鱼是一种小型鱼群,富含脂质。因此,玉筋鱼成为从鲸鱼、鲨鱼到海鸟至少70种不同物种的优质且重要的食物来源。
从新泽西海域一直向北到格陵兰岛都可以发现北方玉筋鱼。包括鲍曼和博士生卢卡斯·琼斯(Lucas Jones)在内的研究人员很想知道,玉筋鱼是否构成了一个庞大的同质种群,或者是否存在基因差异的种群。他们的研究结果发表在ICES海洋科学杂志(ICES Journal of Marine Science)。
鲍曼解释说,在考虑物种的保护和可持续管理时,这些都是需要回答的重要问题,特别是由于气候变化,玉筋鱼生活地区的气候变暖速度比地球上许多地区都快得多。
从如此广泛的范围内对鱼类进行采样绝非易事,但两年前,鲍曼和琼斯开始联系其他研究人员,想要获知他们是否有多余的组织样本。鲍曼将这项工作归功于国际小组的同事,他们提供了样本,其中包括来自加拿大和格陵兰岛的合著者,并帮助对数据进行排序和分析,这其中包括康奈尔大学的合著者。
总而言之,鲍曼、琼斯和团队使用一种称为全基因组低深度重测序(low-coverage whole genome sequencing)的技术,对来自玉筋鱼存在范围内不同地点的近300个样本进行了测序和分析。他们还对玉筋鱼的第一个参考基因组进行了测序。
简而言之,鲍曼说,他们在新斯科舍省(Nova Scotia)海岸外的斯科舍大陆架(Scotian Shelf)上发现了一个基因断裂的区域。研究人员区分出两个截然不同的群体,一个在分界线的北部,一个在分界线的南部,基因组的部分差异非常大,即在染色体21和24上。鲍曼说,如果没有像山脉这样明显的物理障碍将这些群体分开,那么我很有可能会问这些差异是如何形成的。
鲍曼说:“这是一个科学难题,”而答案似乎就在洋流中。
鲍曼说:“当来自北方的鱼类繁殖并向南漂流时,它们在基因上不太适应温暖的南方水域,即使冬天温暖5到6度,它们也无法生存。”“这些种群可能与洋流有关,但实现连通的可能性基本为零。”
这是玉筋鱼的首次发现,但在龙虾、鳕鱼和扇贝等其他物种中也有类似发现,这项研究进一步为斯科舍大陆架存在明显的温差提供了证据,并有助于证明温度是生存的重要因素。
“一个又一个例子表明,海洋并不像预期的那样均匀,有各种各样的东西阻止了这种洋流之间持续的混合。”鲍曼表示,“我们发现了另一个引人注目的例子。”
鲍曼说,当研究人员在混合持续的环境中发现适应性时,就会问一个问题,比如,在海洋中,物种如何保持差异,即使它们不断遇到其他基因型。这就是该篇论文中使用的强大的基因组方法的用武之地。
鲍曼说:“许多物种的部分基因组都有我们所说的‘基因反转’,这意味着来自亲代一方的染色体上的基因有一定的顺序,而来自另一方的同一染色体上的编码相同的基因,它们在同一区域,但被反转了”
这些反转意味着重组不能发生;因此,这些基因代代相传,在适应过程中发挥着重要作用。
“我们发现,在21号和24号染色体上,有完全不同的整个区域,由于没有重组,这就像我们所说的反转标志。”
鲍曼表示,知道斯斯科舍大陆架上存在遗传和生态屏障很重要,因为随着气候变化,这一屏障可能会向北移动,虽然这对南方鱼类来说可能是个好消息,但对目前在那里的鱼类来说却是个坏消息。
研究人员在发现两个集群时也松了一口气,因为如果有许多较小的集群,管理和养护可能会更具挑战性,尤其是考虑到海上风电场的建设等情况。适合安装风力涡轮机的地方也可能是玉筋鱼的栖息地,而建筑会破坏栖息地。如果有许多较小的集群,一个建筑项目可能会带来完全消灭集群的风险,而对于更广泛分散的集群,尽管当地集群可能会暂时受到干扰,但它们很快就能在建筑完成后重新恢复。
鲍曼计划将进一步的研究重点放在研究热分裂的遗传基础上。
鲍曼说:“尽管气候变化,我们希望确保这种鱼类的繁殖能力力和适应能力。因此,我们应该确保在它们的分布地区得到保护。”“这些决定应该包括专家,以确保如果有一个对玉筋鱼非常关键的区域,任何干扰都是暂时的。”
鲍曼说,这不是一场无法解决的冲突,却我们所需要做的事情。他还指出,由于该地区变暖速度更快,热区以北的玉筋鱼可能已经受到了更多的变暖影响。
他说:“这两个集群可能对气候变化有不同的脆弱性,我们还不知道,但这是应该研究的方向。”
研究报告来源:
Lucas F Jones, R Nicolas Lou, Christopher S Murray, Dominique Robert, Christina M Bourne, Caroline Bouchard, Marek Kučka, Y Frank Chan, David B Carlon, David N Wiley, Nina O Therkildsen, Hannes Baumann. Two distinct population clusters of northern sand lance (Ammodytes dubius) on the northwest Atlantic shelf revealed by whole genome sequencing. ICES Journal of Marine Science, 2022; DOI: 10.1093/icesjms/fsac217.
编译者:陈影
审校者:张仲杰(Hugo Zhang)
新闻来源:ScienceDaily网